Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tnnt3Q9QZ47 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms