Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Limd1Q9QXD8 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Limd1Q9QXD8 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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