Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms