Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Cd28-201ENSMUST00000027165 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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