Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Usp12Q9D9M2 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Usp12Q9D9M2 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Usp12Q9D9M2 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp12Q9D9M2 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp12Q9D9M2 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp12Q9D9M2 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp12Q9D9M2 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp12Q9D9M2 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Usp12Q9D9M2 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms