Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms