Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Apobec3Q99J72 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms