Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms