Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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