Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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