Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms