Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Ubxn2bQ0KL01 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ubxn2bQ0KL01 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms