| Hoxd1 | Q01822 | Gm2004-203 | ENSMUST00000179349 | 195 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm21904-201 | ENSMUST00000179522 | 543 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22917-201 | ENSMUST00000180116 | 110 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm27286-201 | ENSMUST00000184934 | 179 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm29228-201 | ENSMUST00000185489 | 418 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm6802-202 | ENSMUST00000186566 | 126 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm29634-201 | ENSMUST00000188467 | 696 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm28699-201 | ENSMUST00000189193 | 696 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm28920-201 | ENSMUST00000189957 | 699 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm18971-201 | ENSMUST00000197240 | 374 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mirlet7f-1-201 | ENSMUST00000198652 | 89 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm18100-201 | ENSMUST00000200897 | 452 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm44611-201 | ENSMUST00000207507 | 355 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm44543-201 | ENSMUST00000209136 | 396 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC109212.1-201 | ENSMUST00000215561 | 427 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | 1700024I08Rik-203 | ENSMUST00000222372 | 754 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | CT009713.9-201 | ENSMUST00000223604 | 389 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC119241.1-201 | ENSMUST00000223651 | 534 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC160930.1-201 | ENSMUST00000227194 | 337 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC102291.2-201 | ENSMUST00000228083 | 367 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr727-201 | ENSMUST00000079142 | 1035 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | n-R5s162-201 | ENSMUST00000082581 | 119 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1270-206 | ENSMUST00000217139 | 4803 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr128-202 | ENSMUST00000216440 | 3644 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC153150.1-201 | ENSMUST00000226065 | 3782 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Zfp708-203 | ENSMUST00000190566 | 2406 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr19-202 | ENSMUST00000206365 | 1967 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn1r169-203 | ENSMUST00000227547 | 2322 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Cfap97-206 | ENSMUST00000164504 | 4521 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Pkhd1l1-203 | ENSMUST00000209244 | 12949 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm21750-201 | ENSMUST00000098874 | 1497 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn1r72-203 | ENSMUST00000227010 | 6279 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Fam135a-206 | ENSMUST00000187369 | 4976 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr186-202 | ENSMUST00000206463 | 2208 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm8675-201 | ENSMUST00000201408 | 1856 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Oog3-201 | ENSMUST00000050933 | 1865 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25213-201 | ENSMUST00000102388 | 113 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22778-201 | ENSMUST00000104090 | 128 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23133-201 | ENSMUST00000104255 | 135 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm11673-201 | ENSMUST00000117846 | 331 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Sult2a-ps3-201 | ENSMUST00000117899 | 428 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14688-201 | ENSMUST00000119169 | 303 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm12852-201 | ENSMUST00000119478 | 719 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm13482-201 | ENSMUST00000119842 | 254 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Clec2f-201 | ENSMUST00000121051 | 374 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Rhox11-ps1-201 | ENSMUST00000121945 | 387 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14366-201 | ENSMUST00000121970 | 730 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | 1700061F12Rik-201 | ENSMUST00000132414 | 876 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22312-201 | ENSMUST00000158005 | 130 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn1r-ps65-201 | ENSMUST00000174235 | 951 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Pid1-206 | ENSMUST00000176822 | 1119 nt | TSL 2 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23619-201 | ENSMUST00000178411 | 94 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25474-201 | ENSMUST00000179052 | 94 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22047-201 | ENSMUST00000179176 | 94 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | 1810044D09Rik-201 | ENSMUST00000186472 | 486 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm29335-201 | ENSMUST00000188361 | 459 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm43035-201 | ENSMUST00000197626 | 517 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm7041-201 | ENSMUST00000201227 | 524 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm43954-201 | ENSMUST00000204634 | 544 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Med7-201 | ENSMUST00000020665 | 1193 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm45839-201 | ENSMUST00000209884 | 399 nt | TSL 5 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm3442-201 | ENSMUST00000216808 | 710 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC153870.1-201 | ENSMUST00000219599 | 560 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC119573.1-201 | ENSMUST00000227960 | 757 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1013-201 | ENSMUST00000065626 | 918 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | BC048502-201 | ENSMUST00000065978 | 718 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1048-201 | ENSMUST00000099900 | 963 nt | APPRIS P2 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gpm6a-201 | ENSMUST00000033915 | 3215 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Ifi208-202 | ENSMUST00000169857 | 1767 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC124346.2-201 | ENSMUST00000217986 | 5083 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr69-201 | ENSMUST00000106878 | 2829 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | D130004A15Rik-201 | ENSMUST00000201492 | 1577 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Lrp1b-201 | ENSMUST00000052550 | 16294 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm6757-201 | ENSMUST00000189810 | 1706 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Epyc-201 | ENSMUST00000020094 | 1723 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm37625-201 | ENSMUST00000194969 | 4872 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Rmi1-202 | ENSMUST00000224479 | 4212 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Abi3bp-204 | ENSMUST00000171000 | 3877 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn2r90-201 | ENSMUST00000169805 | 2592 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr873-205 | ENSMUST00000215540 | 3784 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | 4921515E04Rik-203 | ENSMUST00000227364 | 2309 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn2r30-202 | ENSMUST00000174368 | 3688 nt | TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm31371-201 | ENSMUST00000211848 | 2088 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25563-201 | ENSMUST00000104603 | 74 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Fam122c-201 | ENSMUST00000114835 | 745 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm16431-201 | ENSMUST00000117454 | 431 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14731-201 | ENSMUST00000119216 | 376 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm6591-201 | ENSMUST00000121063 | 434 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm12087-201 | ENSMUST00000121878 | 258 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm3669-203 | ENSMUST00000133259 | 677 nt | TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm13371-201 | ENSMUST00000137756 | 469 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm16331-201 | ENSMUST00000144274 | 498 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14974-202 | ENSMUST00000150003 | 677 nt | TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm2165-204 | ENSMUST00000153493 | 677 nt | TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm2101-205 | ENSMUST00000156730 | 677 nt | TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm26001-201 | ENSMUST00000157989 | 103 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24930-201 | ENSMUST00000158315 | 83 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22765-201 | ENSMUST00000158371 | 128 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm6486-201 | ENSMUST00000166202 | 434 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23799-201 | ENSMUST00000175559 | 120 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |