Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms