Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms