Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Brpf1B2RRD7 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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