Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Spocd1B1ASB6 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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