Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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Grik3B1AS29 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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