Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Prdm16A2A935 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms