Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col4a3Q9QZS0 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms