Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms