Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Csnk1eQ9JMK2 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Csnk1eQ9JMK2 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms