Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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