Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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Cldn12Q9ET43 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn12Q9ET43 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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