Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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Smg8Q8VE18 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Smg8Q8VE18 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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