Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Gm20854Q62461 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm20854Q62461 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms