Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.05
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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