Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
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