Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms