Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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