Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
DffaO54786 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
DffaO54786 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
DffaO54786 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
DffaO54786 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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