Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FxnO35943 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FxnO35943 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FxnO35943 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FxnO35943 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms