Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms