Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Atp8b5A3FIN4 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Atp8b5A3FIN4 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms