Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Rabgef1Q9JM13 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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