Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Ccdc47Q9D024 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc47Q9D024 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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