Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cnot1Q6ZQ08 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms