Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
NipblQ6KCD5 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NipblQ6KCD5 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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