Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Brip1Q5SXJ3 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Brip1Q5SXJ3 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms