Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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Trappc1Q5NCF2 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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