Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc34Q3UI66 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms