Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rnf40Q3U319 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf40Q3U319 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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