Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Trim71Q1PSW8 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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