Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
Hoxd1Q01822 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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Hoxd1Q01822 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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Hoxd1Q01822 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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Hoxd1Q01822 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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Hoxd1Q01822 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Hoxd1Q01822 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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