Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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VdrP48281 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VdrP48281 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VdrP48281 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
VdrP48281 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
VdrP48281 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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