Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtpraP18052 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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