Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Sdc4O35988 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Sdc4O35988 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Sdc4O35988 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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