Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms