Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ArxO35085 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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ArxO35085 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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ArxO35085 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ArxO35085 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ArxO35085 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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