Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Grik3B1AS29 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms