Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Riok3Q9DBU3 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms